斑馬魚幼體高通量圖像采集自動(dòng)操作系統(tǒng)

VAST BioImager? Platform 

VAST BioImager系統(tǒng)是專門為2-7天幼體斑馬魚的高通量圖像采集而設(shè)計(jì)。該系統(tǒng)是在美國(guó)麻省理工學(xué)院Yanik實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展而來(lái)。VAST BioImager在采集圖像之前自動(dòng)完成斑馬魚幼體裝載、定位、旋轉(zhuǎn)等操作，避免了在進(jìn)行高通量圖像采集時(shí)對(duì)斑馬魚幼體人工操作的時(shí)間損耗和冗長(zhǎng)的步驟。同時(shí)它也是一個(gè)組裝式和可拓展的平臺(tái)，能安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上進(jìn)行高分辨率、細(xì)胞水平上的圖像采集。

型號(hào)：VAST BioImager

產(chǎn)品特點(diǎn)：

· 適用于高通量&高內(nèi)涵篩選

· 可安裝在多種直立復(fù)式顯微鏡或者立體顯微鏡上

· 可安裝在熒光顯微鏡上進(jìn)行熒光圖像采集

· 配合高階分析軟件，可實(shí)現(xiàn)對(duì)斑馬魚的高精度定位和高分辨率成像

· 可選配LP Sampler自動(dòng)加樣器，可實(shí)現(xiàn)從96孔板中取樣，傳送斑馬魚幼體到VAST系統(tǒng)進(jìn)行圖像采集

主要功能：

· 專為模式生物研究而設(shè)是斑馬魚研究的有力工具

· 自動(dòng)處理圖像采集前斑馬魚幼體的各種操作

· 避免人工操作的時(shí)間損耗和冗長(zhǎng)的步驟

· 在軟件上點(diǎn)擊“Load one Fish”，VAST就會(huì)裝載好一個(gè)斑馬魚幼體

· 系統(tǒng)可將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，從側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集

高分辨率顯微鏡載物臺(tái)和安裝套件

VAST配合實(shí)驗(yàn)室的顯微鏡一起使用，一旦使用機(jī)載攝像頭定位幼蟲，VAST內(nèi)部光源就會(huì)關(guān)閉，并且可以使用顯微鏡的光學(xué)器件和攝像頭捕獲高分辨率圖像；

在配備熒光功能的顯微鏡上安裝 VAST 可以收集熒光圖像；

多角度成像

將斑馬魚幼體進(jìn)行360°旋轉(zhuǎn)定位，操作者可根據(jù)自己的意愿選擇方向，側(cè)面、背面或者其他方向進(jìn)行圖像采集

高階版 VAStomography? 軟件（選配）

能夠在幾分鐘內(nèi)生成3D光學(xué)投影斷層掃描 (OPT)
選定感興趣區(qū)域的體積、形狀和位置數(shù)據(jù)集
使用 VolView/ParaView 進(jìn)行 3D 可視化
使用 MATLAB/Python 進(jìn)行數(shù)據(jù)處理

從用 Col2-H2a-mCherry 標(biāo)記的 4 dpf 斑馬魚幼蟲的熒光圖像構(gòu)建斷層掃描

A 腹面觀，B 側(cè)視圖，C 用VASTomography 軟件對(duì)同一條魚進(jìn)行3D斷層掃描

手動(dòng)加樣器

手持式流通式移液器通過(guò)單擊按鈕，將斑馬魚裝載到 VAST中

LP Sampler自動(dòng)進(jìn)樣器

能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)多孔板樣品的自動(dòng)化加樣

完整的圖像采集系統(tǒng)

VAST斑馬魚高通量圖像采集系統(tǒng)可配合LP Sampler組成一套更加完整的高通量拍照平臺(tái)

能夠?qū)崿F(xiàn)從多孔板自動(dòng)進(jìn)樣到顯微鏡成像平臺(tái)

VAST BioImager的部分文章：

·Nature Methods, 2010, 7 600-601 and 634-636, Carlos Pardo-Martin, Tsung-Yao Chang, Bryan Kyo Koo, Cody L Gilleland, Steven C Wasserman and Mehmet Fatih Yanik

·Lab Chip, 2012, 12 711-716, Tsung-Yao Chang, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Carolina W?hlby and Mehmet Fatih Yanik

·Nature Communications, 4, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475, Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimon, Carolina W?hlby, Mehmet Fatih Yanik